同安区总工会机关设立九个部室，分别是：办公室、组织基层部、经济部、宣传教育部、财务部、审计室、法律与保障部、女职工部、职工服务中心。下属事业单位1个,即区工会职工服务中心,另有区劳模协会、区文娱体育联合会、区离退休职工联合会。

主要职责是：
（1）组织指导各级工会贯彻党和国家关于工人运动、工会工作方针、政策的落实，进一步突出和履行工会的维权职责。
（2）研究、制定全区工会工作计划，组织实施和完成上级工会的工作布暑和任务，指导各级工会积极完成本级工会的各项决议。
（3）参与涉及职工切身利益的地方性规定的研究、制定。
（4）加强指导基层工会组织的规范化建设，开展建设“职工之家”活动。
（5）指导基层工会开展以职工代表大会为基本制度的民主选举、民主决策、民主管理和民主监督工作，研究和推动基层工会建立平等协商、集体合同制度的监督保证机制。
（6）围绕经济建设中心，组织和指导基层工会开展群众性的经济技术创新活动。
（7）协助有关部门抓好机关、企事业单位的劳动安全卫生和社会保障工作；参与职工重大伤亡事故的处理；依法维护女职工的特殊权益；做好职工的疗休养工作和开展“送温暖工程”。
（8）协调劳动关系，参与调解社会矛盾。推动劳动关系三方协商机制的建立和完善。
（9）根据政府委托，与有关部门共同做好劳动模范和先进生产（工作）者的推荐评选、表彰、培养和管理工作。
（10）宣传党的路线、方针、政策，加强职工服务中心建设，开展职工政治思想、科学文化技术教育和文娱、体育活动，建设“四有”职工队伍。
（11）负责全区工会经费的收缴、管理、使用和审计工作。做好区工会直属企事业单位的管理工作。
（12）围绕党和政府的中心工作以及工人运动、工会工作等重大课题，开展调查和研究。
（13）协助区有关党组织管理工会干部和中层领导，抓好工会干部教育培训，提高工会干部素质。
（14）发展同台、港、澳工会和国外工会的交流与合作。
（15）承担区委、区政府及上级工会交办的其他事项。